Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms