Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RLBP1P12271 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RLBP1P12271 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms