Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHGAP10645 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHGAP10645 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHGAP10645 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHGAP10645 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHGAP10645 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHGAP10645 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHGAP10645 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHGAP10645 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHGAP10645 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHGAP10645 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHGAP10645 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHGAP10645 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHGAP10645 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHGAP10645 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHGAP10645 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHGAP10645 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHGAP10645 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHGAP10645 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHGAP10645 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHGAP10645 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms