Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LYNX1P0DP58 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms