Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms