Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD2O96028 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD2O96028 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD2O96028 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD2O96028 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD2O96028 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD2O96028 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD2O96028 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD2O96028 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD2O96028 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD2O96028 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD2O96028 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD2O96028 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD2O96028 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD2O96028 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD2O96028 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD2O96028 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD2O96028 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD2O96028 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD2O96028 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD2O96028 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD2O96028 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD2O96028 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD2O96028 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD2O96028 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD2O96028 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms