Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZBED1O96006 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ZBED1O96006 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZBED1O96006 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ZBED1O96006 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZBED1O96006 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZBED1O96006 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZBED1O96006 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZBED1O96006 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZBED1O96006 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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