Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT4O95628 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms