Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRATO95237 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRATO95237 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRATO95237 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRATO95237 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LRATO95237 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRATO95237 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRATO95237 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRATO95237 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRATO95237 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRATO95237 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms