Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP19O94966 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP19O94966 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP19O94966 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP19O94966 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP19O94966 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms