Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBBP9O75884 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms