Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX3O75364 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms