Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF4O60810 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms