Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SELENOFO60613 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SELENOFO60613 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms