Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms