Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCA5O60264 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms