Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF1O43189 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF1O43189 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms