Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F3O00716 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F3O00716 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F3O00716 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F3O00716 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F3O00716 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F3O00716 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F3O00716 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms