Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms