Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms