Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN25C9JDP6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms