Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DXG7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DXG7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DXG7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DXG7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DXG7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DXG7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DXG7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DXG7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DXG7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DXG7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DXG7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DXG7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DXG7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DXG7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DXG7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms