Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms