Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC69A6NI79 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms