Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB19A4D1S5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms