Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC144AA2RUR9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms