Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMX2A2RU54 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms