Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCE3A1L190 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCE3A1L190 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYCE3A1L190 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYCE3A1L190 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms