Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N4

TRBV25-1, T-cell receptor beta variable 25-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV25-1A0A075B6N4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms