Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms