Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHBDD3Q9Y3P4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms