Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms