Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC3Q9UQE7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms