Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms