Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms