Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA11Q9UKX5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA11Q9UKX5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms