Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP25Q9UHP3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP25Q9UHP3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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