Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA6Q9UF33 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms