Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms