Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms