Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms