Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDP1Q9P0J1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms