Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP5Q9NZZ3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms