Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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