Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC4Q9NTJ3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms