Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL1Q9NSC2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms