Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms