Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELL3Q9HB65 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms