Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms