Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms